Cas9蛋白是一種切割外來DNA的酶,像一把分子剪刀。該蛋白通常與兩個RNA分子結合:crRNA和另一個稱為tracrRNA(或“反式jihuocrRNA”)。這兩個RNA分子引導Cas9到它將進行切割的目標部位。這段DNA是與crRNA的20個核苷酸互補的。CRISPR技術是從細菌和古細菌的自然防御機制中改編而來的。這些生物體使用CRISPR衍生的RNA和各種Cas蛋白,包括Cas9,來阻止病毒和其他異物的攻擊。它們主要通過切碎和破壞外來入侵者的DNA來做到這一點。當這些組件被轉移到其他更復雜的生物體中時,它允許對基因進行操縱,或“編輯”。挑選前面的潛在脫靶位點,通過PCR測序驗證是否脫靶。嘉興基因編輯技術脫靶檢測評估
對于CAR修飾的免疫細胞,應采用多種體外方法評估其胞外抗原識別區的脫靶風險。TCR修飾免疫細胞的脫靶毒性可通過評估TCR與人體自身抗原肽的交叉識別能力來評估。首先,應采用體外試驗測定TCR修飾的免疫細胞與人自身抗原肽-HLA(與遞呈靶抗原肽的HLA等位基因相同)復合物的親和力,并說明抗原肽的選擇依據及選擇范圍。此外,還應研究其他相關或不相關的蛋白中是否含有靶抗原肽序列。如果TCR與人自身抗原肽有交叉反應可能,應確定靶抗原肽的較小識別基序(motif),并采用計算機預測分析評估交叉反應性。如果計算機預測可識別出具有潛在交叉反應性的抗原肽,應在體外測定TCR修飾免疫細胞對表達相應蛋白或遞呈相應抗原肽的的細胞的識別能力。如果不能排除交叉反應性,應基于含有潛在交叉反應性抗原肽的蛋白的表達模式以及TCR與潛在交叉反應性抗原肽的親和力來進行風險評估。為獲得TCR與其他等位HLA潛在交叉反應性的信息,應進行充分的HLA交叉反應性篩選。武漢高精度脫靶檢測技術脫靶(off-target)效應是指MicroRNA Agomir/Antagomir可以與特異性互補的核苷酸序列結合。
基因編輯產品除了適用基因zhiliao產品的一般考慮以及整合性載體的特殊考慮外,長期隨訪中還應額外關注脫靶風險,量化評估脫靶活性和在靶活性之間的相關性,或利用在靶活性來預測脫靶活性的水平。在開發過程中應同時關注基因轉導效率、脫靶效率、插入突變情況、目的基因在靶細胞中整合位點及表達。評估基因zhiliao產品整合進基因組的可能性,判斷是否需要開展另外的遺傳毒性研究,評估插入突變(插入位點、插入拷貝數等)引起的遺傳毒性風險。需要關注脫靶編輯、轉座子轉座印跡引起的遺傳毒性問題;鑒定/表征基因組整合位點。非臨床研究是藥物開發的重要環節之一。
使用CRISPR/Cas9、ZFNs和TALENs等設計核酸酶進行基因組編輯,可以將遺傳物質定向導入哺乳動物基因組的特定位點。然而,可能會出現非預期的靶上和靶外基因組修飾,這可能導致基因組不穩定,并破壞正常基因的功能,從而可能導致臨床前和臨床研究中的安全問題。基因編輯目前的脫靶分析技術主要依賴于生物信息學預測和全基因組脫靶檢測技術。這些預測缺乏可靠性,因為它們只涵蓋了潛在基因組改變的一小部分。而頻率低于0.5%的脫靶突變大多無法被全基因組脫靶檢測技術檢測到。我們是開發用于全基因組靶向/非靶向分析的無偏分析的先驅。靶向基因組編輯唯可生物為基因編輯安全性評估提供多方面的PCR和基于NGS的分析。我們的多功能且經濟高效的檢測方法可檢測靶向和非靶向基因組改變。我們先進的分析技術與強大的內部生物信息學體系相結合,可靠地量化了預期的靶向整合與非預期結果(如易位和INDEL)之間的比率。脫靶檢測服務,推薦唯可生物,實驗實力強,專業性高,檢測效率高,結果準確率高。
通常不需要進行標準的遺傳毒性組合試驗,但應根據基因zhiliao產品的特點、產品的具體適應癥、載體的已有信息、導入基因序列結構等,評估基因zhiliao產品整合進基因組的可能性,判斷是否需要開展另外的遺傳毒性研究,如研究基因組修飾的發生情況,并檢測隨后可能發生的異常細胞行為;評估插入突變(插入位點、插入拷貝數等)引起的遺傳毒性風險。當基因zhiliao產品采用基因編輯或轉座子技術時,需要關注脫靶編輯、轉座子轉座印跡引起的遺傳毒性問題;鑒定/表征基因組整合位點。基因編輯脫靶檢測,推薦唯可生物,實驗實力強,專業性高,檢測效率高,結果準確率高。武漢高精度脫靶檢測技術
預算允許的情況下,通過全基因組測序的方法進行全基因組序列的分析和比對更精細,如基于NGS的iGUIDE方法。嘉興基因編輯技術脫靶檢測評估
gRNA的長度和錯配: 17個核苷酸長度的gRNA顯示出更高的基因組編輯效率。相比之下,18-20 bp的長度顯示出較低的基因組編輯效率。在人類細胞中減少潛在脫靶效應的指導方針:1) 應避免在PAM的7-10 bp范圍內靶序列有超過3個錯配;2) 在PAM的12 bp內,應避免sgRNA 凸起以減少脫靶效應。gRNA的化學修飾:在gRNA核糖磷酸骨架中加入2?-O-甲基-3?-膦酰基乙酸酯會導致位點特異性修飾,使脫靶切割減少40-120倍,同時保持靶向性能。gRNA上游5'發夾結構的修飾可以提高Cas9和Cas12的特異性,降低脫靶效應。嘉興基因編輯技術脫靶檢測評估
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