無細胞蛋白表達技術在實際應用中也存在一些技術短板。由于反應體系缺乏活細胞的代謝調控機制，能量供應和原料再生效率較低，導致反應持續時間較短（通常只維持4-6小時），限制了蛋白產量的進一步提升。同時，該技術對反應環境高度敏感，溫度波動、氧化應激或污染物都可能影響蛋白合成效率，這對實驗操作的穩定性提出了更高要求。此外，雖然CFPS能表達傳統細胞系統難以生產的毒性蛋白，但對于需要復雜折疊或多亞基組裝的蛋白（如某些膜蛋白或超大分子復合物），其成功率仍然有限。大腸桿菌體外蛋白表達的單次反應成本（$1.5）只為哺乳細胞系統的 1/50。大腸桿菌可溶蛋白表達發展前景

在無細胞蛋白表達技術（CFPS）領域，Thermo Fisher Scientific和Merck KGaA等生命科學巨頭占據主導地位，它們提供標準化的商業化試劑盒（如Thermo的PURExpress®和Merck的RTS 100系統），覆蓋科研到工業級需求。這些企業通過成熟的供應鏈和全球分銷網絡，為制藥、診斷客戶提供一站式解決方案。此外，Takara Bio（寶生物工程）憑借其高效真核裂解物技術，在復雜蛋白表達（如糖基化抗體）細分市場表現突出。這些綜合服務商正通過收購創新企業（如Thermo收購CellFree Tech）進一步鞏固技術壁壘。his標簽蛋白表達技術添加 0.1% Triton X-100 使疏水蛋白的體外表達可溶率達90%??。

若需實現高階應用（如非天然氨基酸插入、膜蛋白合成），無細胞蛋白表達技術復雜度會明顯提升。例如，插入Azidohomoalanine需定制正交tRNA合成酶體系，且需優化反應中nnAA與天然氨基酸的比例；表達膜蛋白時則需添加脂質體或納米盤以維持蛋白折疊。此類實驗往往涉及多學科知識（合成生物學、生物化學），并依賴特殊設備（如微流控芯片工作站）。不過，隨著商業化試劑盒（如Thermo的PUREfrex2.0）和自動化平臺（如ArborBio的AI優化系統）的普及，部分操作正趨于標準化，降低了技術門檻。

體外蛋白表達（InVitroProteinExpression）是指在無完整活細胞的環境下（如試管、微孔板或芯片），利用生物提取物中的核糖體、tRNA、酶及能量系統，直接將遺傳信息轉化為功能蛋白質的技術。與傳統細胞依賴的系統不同，該技術完全避開了細胞膜屏障和基因復制過程，只通過添加目標DNA/RNA模板及底物（氨基酸、ATP）即可啟動蛋白表達。這一過程通常可在1-4小時內完成，其速度優勢大幅加速了蛋白質研究進程。無細胞蛋白表達系統的重點在于重構翻譯機器，例如提取大腸桿菌裂解物中的核糖體，或利用兔網織紅細胞裂解物中的真核翻譯因子，以實現跨物種的高效蛋白表達。用微流控技術整合裂解物分配\DNA模板加載及反應監測模塊可在??單張芯片上并行執行千次蛋白表達反應??.

盡管體外蛋白表達在科研領域優勢明顯，其規模化應用仍面臨三重挑戰：裂解物制備成本高： 真核裂解物（如兔網織紅細胞）的原料獲取與標準化生產難度大，單位成本遠超微生物發酵；反應體系穩定性不足： 蛋白酶/核酸酶導致的產物降解及底物（如ATP）快速耗竭限制持續合成時間；產物濃度天花板： 當前比較好工藝的蛋白產量約5g/L，較CHO細胞系統（>10g/L）存在差距。解決這些瓶頸需開發 工程化裂解物（如RNase缺陷型菌株）與連續流灌注技術，提升經濟可行性小麥胚芽裂解物??則憑借??低核酸酶活性??成為長期反應（>24小時）的理想選擇。定制蛋白表達陰性

每一次體外蛋白表達的反應液微光，都在照亮人類準確操控生命分子的前沿征途。大腸桿菌可溶蛋白表達發展前景

前沿高校和研究所是無細胞蛋白表達技術創新的源頭。哈佛大學George Church實驗室開發的"全基因組裂解物"技術，明顯提升了復雜途徑的體外重構能力；東京大學則通過微流控-無細胞蛋白表達技術聯用系統，推動單細胞蛋白組學研究。值得注意的是，合成生物學公司（如Ginkgo Bioworks、Zymergen）正將無細胞蛋白表達技術納入其自動化生物鑄造平臺，用于高通量酶進化。而傳統發酵技術公司（如DSM）也開始布局無細胞蛋白表達技術，探索其在可持續蛋白（如無細胞合成乳清蛋白）中的應用，預示著技術融合的跨界競爭趨勢。大腸桿菌可溶蛋白表達發展前景